La flotte d'Air Malta était composée des avions Airbus suivants le jour de sa disparition, le 30 mars 2024 :
| Appareils | En service | Commandés | Passagers | Notes |
|---|---|---|---|---|
| Airbus A320-200 | 2 | — | 164 | 9H-AEK, 9H-AEP, 9H-AEQ, 9H-AHS |
| Airbus A320neo | 6 | — | 176 | 9H-NEO, 9H-NEB, 9H-NEC, 9H-NED |
| Total | 8 |